مشخصات پژوهش

صفحه نخست /موقعیت فیلوژنتیکی گونه ...
عنوان موقعیت فیلوژنتیکی گونه Tylenchorhynchus dubius جمع آوری شده از ریزوسفر شلغم شهرستان بافت (کرمان) بر اساس توالی 28srDNA
نوع پژوهش مقاله ارائه شده
کلیدواژه‌ها کرمان، فیلوژنی، نماتود، Tylenchorhynchus ، 28S rDNA.
چکیده جنس Tylenchorhynchus یکی از نماتودهای خانواده Belonolaimidae می باشد که در جمعیت بالا می تواند موجب خسارت در محصولات باغی و زراعی شود. در حین نمونه برداری از خاک های مزارع شلغم (Brassica rapa L) منطقه بافت در استان کرمان گونه ای از جنس Tylenchorhynchus جداسازی گردید که بر اساس کلیدها و شرح های موجود T.dubius شناسایی شد. به منظور شناسایی دقیق تر و تعیین موقعیت فیلوژنتیکی این جمعیت، قطعه D2D3 ناحیه ژنی 28S rDNA با استفاده از پرایمر های اختصاصی تکثیر و توالی یابی شد. نتایج آنالیز فیلوژنتیکی با استفاده از روش Neighbor Joining و نرم افزار مگا 5 نشان داد که جمعیت مورد مطالعه با جمعیت هایی از همین گونه از کشور امریکا (EU368590; DQ328707 ) با ارزش بوتستراپ 100 در یک شاخه قرار می گیرند. بررسی فاصله ژنتیکی نشان داد که جمعیت مطالعه شده بیشترین فاصله ژنتیکی با گونه T. claytoni (140/0) و کمترین فاصله ژنتیکی با جمعیت های T. dubius (030/0) دارد. میزان G+C گونه مطالعه شده (3/57) در مقایسه با سایر جمعیت مطالعه از همین گونه در آنالیز فیلوژنتیکی بالاتر می باشد.
پژوهشگران معصومه غریبی نصرآباد (نفر اول)، ذبیح الله اعظمی ساردوئی (نفر دوم)، ابراهیم شکوهی (نفر سوم)، فرناز فکرت (نفر چهارم)