مشخصات پژوهش

عنوان	آنالیز متاژنومیکس جمعیت میکروبی درختان مرکبات مبتلا به زوال در جنوب استان کرمان
نوع پژوهش	طرح پژوهشی خاتمه یافته
کلیدواژه‌ها	MiSeq، توالی یابی نسل آینده، Candidatus Liberibacter SPP.، Candidatus Phytoplasma SPP.
چکیده	عارضه زوال مرکبات طی سالهای اخیر خسارت زیادی به مرکبات پیوند شده روی پایه بکرایی در جنوب کرمان وارد نموده است. به منظور شناسایی اتیولوژی این بیماری و نقش باکتری های اندوفیت بر بروز این عارضه این پروژه با استفاده از روش های مولکولی و متاژنومیکس برای شناسایی بیمارگرها و باکتری های همراه این عارضه انجام شد. در روش های مولکولی معمول با استفاده از پرایمرهای اختصاصی و تکنیک PCR همراهی Candidatus Phytoplasma aurantifolia و Candidatus Liberibacter asiaticus اثبات شد. در بررسی متاژنومیکس با استفاده از پلتفرم MiSeq ایلومینا و توالی یابی ناحیه V1-V3 از 16S rDNA نیز فیتوپلاسما Candidatus Phytoplasma SPP. در همه نمونه ها و Candidatus Liberibacter SPP. در نمونه های با علایم عارضه ردیابی شد. به نظر می رسد همراهی این دو عامل بخصوص باکتری Candidatus Liberibacter SPP.عامل بروز عارضه زوال مرکبات در این منطقه باشد. بررسی جامعه باکتری های اندوفیت ریشه و برگ درختان مرکبات دارای علایم بیماری و درختان سالم نشان داد که از نظر تنوع و جمعیت باکتری ها تفاوتهایی در گیاهان سالم و بیمار دیده می شود. در ریشه و برگهای درختان سالم راسته های Pseudomonadales ، Bacilli و Gammaproteobacteria با فراوانی بیشتر دیده شدند در حالیکه در درختان بیمار راسته های Actinomycetales، Actinobacteria و Rhizobiales از فراوانی بیشتری برخوردار بودند.
پژوهشگران	حمیدرضا علیزاده (نفر اول)، پیروو بیانکو (نفر دوم)، مهدی آزادوار (نفر سوم)