|
عنوان
|
بررسی تبارزایی دو جدایه ی ایرانی ویروس موزاییک رگه ای گندم ) Wheat streak mosaic virus )بر اساس ناحیه ی کد کننده ی پروتئیناز NIa-Pro
|
|
نوع پژوهش
|
مقاله چاپ شده
|
|
کلیدواژه‌ها
|
الایزا، غلات، واکنش زنجیره ای پلیمراز، تبارزایی.
|
|
چکیده
|
چکیده
ویروس موزاییک رگه ای گندم ) WSMV ) Wheat streak mosaic virus از ویروس های خسارت زای غلات مربوط به خانواده
Potyviridae و جنس Tritimovirus است . در این تحقیق، NIa-Pro که یکی از مهم ترین پروتئینازهای این ویروس می باشد،
مورد مطالعه قرار گرفت. بدین منظور 116 نمونه ی علائم دار گندم از مزارع خراسان شمالی، خراسان جنوبی و آذربایجان
غربی جمعآوری و به منظورشناسایی اولیه، کلیه ی نمونهها با آزمون الایزا آزمایش گردیدند و تعداد 10 نمونه در مقابل آنتی
بادی اختصاصی WSMV واکنش مثبت نشان دادند. این 10 نمونه مثبت در گلخانه روی گیاه گندم تکثیر و با آغازگر
اختصاصی مربوط به توالی کامل NIa-Pro در آزمون RT-PCR سنجش شده و قطعه ای به طول 732 جفت باز تکثیر گردید.
سپس دو جدایه متفاوت از نظر جغرافیایی مربوط به آذربایجان غربی و خراسان شمالی، همسانه سازی و تعیین ترادف شد.
در مقایسه ی ترادف های به دست آمده در این تحقیق با ترادف های موجود در ژن بانک، دو گروه تشکیل شد. جدایه های
ایرانی مربوط به این مطالعه در گروه یک، زیر گروه IB و مجزا از جدایه های اروپایی و جدایه ایرانی که در تحقیقات پیشین
تعیین توالی شده بود و نزدیک به جدایه آمریکایی ) NC-001886 (، بودند قرار گرفتند. بررسی مکان های برشی در ژن NIa-Pro نشان داد که مناطق برش، در این پروتئین حفاظت شده است، جایگزینی تعدادی اسید آمینه در مکان های حفاظت شده
نظیر توالی GKSH در محل 124 - 121 ، A/T در جایگاه 154 و گلوتامین با آلانین در جایگاه 208 در جدایه های ایرانی مشهود
بود. تحقیق حاضر اولین بررسی جدایه های ایرانی در ناحیه ی کد کننده مذکور می باشد.
|
|
پژوهشگران
|
سیده عاطفه حسینی (نفر اول)، اسرا سالاری (نفر دوم)
|