|
چکیده
|
شیوع بیامری آنفوالنزای پرندگان با مرگومیر باال، کاهش تولید تخم و کشنت اجباری گلههای آلوده، تأثیر مخربی بر صنعت طیور دارد. براساس پروتئین مرکزی ویروس به سه زیر گروه C,B,A تقسیم میشود. ویروس آنفوالنزای نوع A بسیار شایع میباشد این ویروس ً همه میتواند باعث ابتالی گونههای مختلف پستانداران و پرندگان شود و بیامریزایی بیشرتی نسبت به آنفوالنزای ,C,B دارد و تقریبا
ساله باعث اپیدمی با شدتهای مختلف میشود. اهداف اصالح نژادی برای حفظ سالمت حیوانات منجر به رفاه حیوانات و جلوگیری از رضرهای اقصادی میشود. هدف از پژوهش حارض، استفاده از روش آنالیز شبکه زیستی به منظور شناسایی نشانگرهای کلیدی جدید درگیر در بیامری آنفوالنزای مرغی میباشد. در این مطالعه به منظور دستیابی رسیع به مهمترین ژنهای درگیر در این بیامری دادههای ریزآرایه بیان ژن مربوط به بافت ریه جوجههای آلوده به ویروس از سایت GEO با شامره دسرتسی GSE53931 تهیه گردید. رسم شبکه برهمکنش پروتئین-پروتئین توسط نرمافزار Cytoscape انجام شد. آنالیز کمپلکسهای پروتئینی به کمک MCODE انجام گردید. سه کمپلکس پروتئینی استخراج شد. پروتئینهای seed در کمپلکسها عبارتند از NOB1, RPL10A ,MSH4 که بعنوان نشانگر کلیدی معرفی شدند، همچنین ژنهای RPF1، NEB ،CSRNP1 ،RNF146 ،RPL18A با کمترین درجه بیان و ژنهای SLC6A20 ،SLC17A8 ،PLN ،
NOXO1 ،TMEM179 با بیشرتین درجه بیان در مطالعه حارض میباشند. بیشرت ژنها در رونویسی، تکثیر، ترجمه ژن در ویروس آنفوالنزا نقش دارند. آنالیزهای بر پایه شبکه میتواند به تشخیص ژنهای درگیر در بیامری و ماژول عملکردی بپردازد، که این امر میتواند کمک قابل توجهی در شناسایی عوامل تنظیم کننده و فرآیندهای زیستی دخیل در پاسخ به بیامری آنفوالنزای مرغی داشته باشد.
|