|
چکیده
|
در گذشته تصور بر این بود که تنها ژنوم است که به ارث می رسد یا فنوتیپ افراد را تعیین می کند. اما امروزه میدانیم که مکانیسم های اپی-ژنتیک بر ژن ها و نحوه بیان آن ها تأثیرگذار است. از جمله مکانیسم های اپی ژنتیکی miRNAها هستند . miRNA ، RNAهای کوچک و غیرکد کننده ای هستند که در تنظیم بیان ژن نقش دارد و عملکرد بیولوژیکی متعددی در حیوانات تنظیم می کنند. از جمله عملکرد بیولوژیکی صفت رشد است. رشد یعنی تغییر وزن بدن در واحد زمان و از مهم ترین صفات بهبود یافته در نتیجه بهگزینی ژنتیکی است. در این مطالعه جهت شناسایی ژن های مؤثر بر رشد گاو داده های مورد نیاز از پایگاه داده ای NCBI با شماره دسترسی GSE-25554 دانلود شدند. داده های خام استخراج شده با استفاده از بسته Limma موجود در نرم افزار R با استفاده از روش تحلیل مؤلفه های اساسی کنترل کیفیت شدند. معیارهای شناسایی ژن های با بیان متفاوت و معنی دار، < foldchange<2 2- و Adj P-Valu 0.05 است جهت بررسی بیشتر رابطه بین ژن های از نرم افزار STRING استفاده شد سپس، از نرم افزار Cytoscap جهت ترسیم شبکه استفاده شد. در نهایت با استفاده از نرم افزار miRwalk، miRNA هایی که ژن های متفاوت بیان را تحت تأثیر قرار می دهند شناسایی شد در مطالعه حاضر ژن های PCK1, PC, LIPE, FASN, ACACA, SLC2A4 با درجه پیوند بالاتر از 9 نقش آنها در رشد نمو مورد بررسی قرار گرفت که 315 miRNA بیان آنها را تحت تأثیر قرار می دهد.
|