|
عنوان
|
ماهیت شناسی ژن های با بیان افتراقی در مرحله هایپرتروفی ماهیچه اسکلتی گوسفند
|
|
نوع پژوهش
|
مقاله ارائه شده
|
|
کلیدواژه‌ها
|
رشد و نمو، پایگاه داده GEO
|
|
چکیده
|
هایپرتروفی عضلانی شامل افزایش اندازه عضلات اسکلتی از طریق رشد در اندازه سلولهای مؤثر آن است. یکـی از صـفات مهـم در
پـرورش و اصلاح نژاد صفات مرتبط با رشـد حیـوان اسـت. در این میان سرعت رشد بیشترین توجه را به خود جلب نموده و این
صفت به عنوان معیار اصلی انتخاب در اکثـر طـرح هـای اصـلاح نژادی برای تولید گوشت مورد استفاده قرار گرفته است. بهبود رشد
عضله گوسفند یکی از اقداماتی مهم برای افزایش گوشت است. هدف از این مطالعه شناسایی ژن های موثر در مرحله هایپرتروفی
ماهیچه اسکلتی گوسفند می باشد. در این مطالعه داده ها به صورت خام از پایگاه داده GEOدانلود شدند. کنترل کیفیت داده های
خام پس از دانلود داده ها از پایگاه مذکور با استفاده ازنرم افزار Rبه روش تحلیل مولفه های اصلی و نرمال سازی داده ها و خلاصه
سازی با استفاده از روش استاندارد نرمال سازی داده های بیان انجام شد. بررسی تفاوت بیان ژن جهت شناسایی ژن هایی که در
گوسفند متفاوت بیان شده اند با بسته آماری Limmaدر محیط نرم افزار Rانجام شد. بررسی مسیرهای زیستی توسط پایگاه
DAVIDانجام شد. نتایج تجزیه و تحلیل نشان داد که در بازه های زمانی مختلف 135روز بعد از آبستنی تا یک ماه بعد از تولد
و 135روز بعد از آبستنی تا دو ماه بعد از تولد به ترتیب 1835و 2048ژن بیان متفاوت داشتند. آنالیز مسیرهای بیولوژیکی و ماهیت
شناسی ژن های متفاوت بیان منجر به تشخیص مسیر های مرتبط با رشد و نمو ماهیچه اسکلتی مانند PI3K-Aktو Focal
. شدadhesio
|
|
پژوهشگران
|
فاطمه محمدی نژاد (نفر اول)، محمدرضا محمدآبادی (نفر دوم)، زهرا رودباری (نفر سوم)
|