|
عنوان
|
خوشه بندی مبتنی بر آنتولوژی ژنهای هدف ریز RNAهای مؤثر بر تولید شیر
|
|
نوع پژوهش
|
مقاله چاپ شده
|
|
کلیدواژه‌ها
|
خوشه بندی ژن، تولید شیر ، آنتولوژی ژن، ریز RNA
|
|
چکیده
|
شیر گاو مایعی بسیار مغذی است و بخش مهمی از رژیم غذایی یک فرد میباشد و تمامی مواد مورد نیاز بدن انسان را در خود دارد.
استراتژیهایی که از طریق آن میتوان تولید شیر را تحت تأثیر قرار داد، شناسایی ژنهایی که روی تولید و ترکیب شیر اثر میگذارند و استراتژی
های مربوط به غده پستانی RNA هاییکه بیان ژنهای مؤثر را تحت تأثیر قرار میدهند. در این مطالعه ابتدا دادههای ریز RNA دیگر شناسایی ریز
ها، شناسایی ژنهای RNA پیادهسازی شدند. بعد از مشخص شدن میزان بیان ریز GEO از پایگاه E-GEOD- گاو شیری با کد شناسایی 61227
انجام گردید. سپس برای فرآیند خوشهبندی ژنها بر مبنای ساختار درختی آنتولوژی ژن که miRwalk ها به کمک پایگاه دادهای RNA هدف ریز
استفاده گردید. در مطالعه حاضر براساس AgriGO شامل سه زیر آنتولوژی فرآیند بیولوژیکی، عملکرد ملکولی و جزء سلولی است از نرمافزار
خوشه بندی مبتنی بر آنتولوژی ژنهای هدف نتایج نشان داد که فعالیتهای بیولوژیکی مورفوژنز بافت پستانی و تکثیر سلولهای اپیتلیال در سطح
بسیار معنیداری میباشندکه این فرآیندها در تکامل و توسعه غدد پستان نقش بسیار مهمی دارند ونتایج براساس فعالیت مولکولی نشان داد که
سیگنالدهی با استفاده از پروتئینهای گیرنده کینازی بیشترین سطح معنیداری به خود اختصاص داده است. همچنین نتایج مربوط به بخش اجزا
سلولی نشان داد بیشترین شمار ژنهای هدف در بخش داخلی غشا سلولی ارگانل و غشا پلاسمایی قرار دارند. بنابراین، ژنهای هدفی که تنظیم
کننده این فرآیندهای معنیدار میباشند پتانسیل ایفای نقش قابل توجه جهت یافتن راهکاری هدفمند در راستای بهبود صفت تولید شیر را دارند.
|
|
پژوهشگران
|
سعیده اسکندری نسب سیاهکوهی (نفر اول)، زهرا رودباری (نفر دوم)، محمدرضا بحرینی بهزادی (نفر سوم)
|