|
عنوان
|
تحلیل موتیفهای پروموتری ژنهای هاب مؤثر بر تولید شیر در گاوهای شیری
|
|
نوع پژوهش
|
مقاله ارائه شده
|
|
کلیدواژهها
|
شبکه تعاملات ژنی، اصلاح نژاد مبتنی بر ژن، ژن های هاب، تولید شیر
|
|
چکیده
|
تولید شیر یکی از مهمترین صفات اقتصادی در صنعت دامپروری به شمار میرود که تحت تأثیر عوامل ژنتیکی و محیطی متعددی
قرار دارد. مطالعه حاضر با هدف شناسایی و تحلیل ژنهای کلیدی (هاب) مرتبط با تولید شیر و موتیفهای تنظیمی ناحیه پروموتری
آنها انجام شده است. بدین منظور، دادههای بیان ژن از پایگاه اطلاعاتی GEOاستخراج و ژنهای با بیان معنادار ) (DEGsشناسایی
شدند. سپس، با استفاده از نرمافزارهای STRINGو Cytoscapeشبکههای تعامل ژنی بازسازی گردیده و ژنهای هاب تعیین شدند.
در مرحله بعد، نواحی پروموتری ژنهای منتخب با استفاده از ابزار MEME Suiteمورد بررسی قرار گرفتند و موتیفهای شناساییشده
با بهرهگیری از ابزارهای Tomtomو GoMoتحلیل شدند. نتایج حاصل از این تحلیلها نشان داد که ژنهای YWHAZ ،PXDNو
RPLP0نقشهای کلیدی در فرآیند تولید شیر ایفا میکنند. همچنین، موتیفهای MA1961.1 ،MA0471.2و MA0750.2در
تنظیم بیان ژنهای مرتبط با فرایند شیردهی و سایر فرآیندهای بیولوژیکی مؤثر هستند. این موتیفها با مسیرهای زیستی مرتبط با
ترجمه و انتقال پروتئین در ارتباط بوده و اختلال در آنها میتواند منجر به کاهش عملکرد تولید شیر و بروز اختلالات سلامت در
گاوهای شیری شود. یافتههای این پژوهش با فراهمسازی درکی عمیقتر از مکانیسمهای تنظیمی مولکولی تولید شیر، میتوانند
زمینهساز برنامههای اصلاح نژادی مبتنی بر نشانگرهای ژنتیکی و همچنین پژوهشهای آینده در زمینه بهبود عملکرد گاوهای شیری
باشند
|
|
پژوهشگران
|
سعیده اسکندری نسب سیاهکوهی (نفر اول)، زهرا رودباری (نفر دوم)
|