مشخصات پژوهش

عنوان	شناسایی و بررسی مولکولی ویروس اس سیب زمینی در مزارع سیب زمینی مازندران
نوع پژوهش	پایان نامه
کلیدواژه‌ها	آلودگی مخلوط، پوشش پروتئینی، تبارزایی،نژاد
چکیده	ویروس اس سیب زمینی از عوامل محدود کننده کشت آن در مزارع سیب زمینی استان است. این ویروس متعلق به جنس کارلاویروس با پیکره چند وجهی و ژنوم RNA تک رشته ای بوده و دارای دامنه میزبانی نسبتا محدود می باشد. ویروس مذکور معمولا دارای اثر افزایشی و همراه با سایر ویروس های سیب زمینی در گیاه حضور دارد. این ویروس بر اساس نحوه انتقال با شته و علائم روی Chenopodium quinoa به دو نژاد اردیناری و آندین تقسیم بندی می شود. به منظور شناسایی مولکولی و بررسی پراکنش ویروس طی سال های 1402-1403 تعداد 94 نمونه گیاهی از مزارع سیب زمینی جمع آوری گردید. RNA کل این ویروس استخراج گردید و سپس در آزمون RT-PCR ناحیه ژنی پوشش پروتئینی در تعدادی از نمونه ها تکثیر گردید و باند به اندازه 1119 جفت باز مشاهده شد. نهایتا به دلیل نمونه برداری از سه منطقه استان مازندران، یک نمونه مثبت از هر منطقه انتخاب شد و که برای تعیین توالی به شرکت ماکرو ژن کره ارسال گردید. پس از دریافت توالی ها با استفاده از نرم افزار Blastn آلودگی سه نمونه تایید و با نرم افزارهای فیلوژنی MegaX و Sdtv بررسی گردید. نتایج نشان داد که در بررسی های فیلوژنی دو گروه تشکیل گردید. گروه یک جدایه های ایران، سوریه کره جنوبی، چین، آلمان و در گروه دو تنها جدایه هایی از ایران قرار داشت. که بیانگر این مطلب است که جدایه های ایرانی تشابه بالای ژنتیکی با هم دارند و منطقه جغرافیایی در تنوع ژنتیکی آن ها تاثیر زیادی ندارد.
پژوهشگران	فرامرز جان برارزاده ارمکی (دانشجو)، سیده عاطفه حسینی (استاد راهنما)، اسرا سالاری (استاد مشاور)