01 آذر 1403
زهرا رودباري

زهرا رودباری

مرتبه علمی: دانشیار
نشانی: دانشگاه جیرفت
تحصیلات: دکترای تخصصی / علوم دامی
تلفن: 09132483343
دانشکده: دانشکده کشاورزی

مشخصات پژوهش

عنوان
تجزیه و تحلیل ریزآرایه ژنومی مرتبط با تولید تخممرغ در مرغان تخم گذار
نوع پژوهش مقاله ارائه شده
کلیدواژه‌ها
تخم مرغ، شبکه ژنی، ژنهای عمده اثر
پژوهشگران حمیده نوری صادق، سعیده اسکندری نسب سیاهکوهی، زهرا رودباری

چکیده

صفت تولید تخممرغ، مهمترین صفت مؤثر بر سودآوری اقتصادی سیستمهای پرورش مرغان تخمگذار می باشد و به طور قابل ملاحظهای تحت تأثیر فاکتورهای ژنتیکی نیز قرار میگیرد. در طی سالهای اخیر، تکنیکهای بیولوژی مولکولی با سرعت شگرفی توسعه پیدا کرده و موجب گردیده است تا پروژههای مختلف توالی یابی کل ژنوم، از جمله طیور تکمیل شود و متعاقب آن پانلهای مختلفی از ریز آرایهها طراحی شده و انجام مطالعات پروفایلهای بیانی را امکان پذیر نماید. مطالعه پروفایل بیانی میتواند به شناسایی دقیق ژنهای مرتبط با صفات اقتصادی کمک کرده و نتایج آن برای انتخاب به کمک نشانگرهای ژنتیکی مفید باشد. در پژوهش کنونی، دادههای پروفایل بیان ژن با شماره دسترسی GSE40802مربوط به دو نژاد مرغ تخمگذار از پایگاه داده GEOاستخراج گردید. دادههای موجود شامل دادههای خام پردازش نشده بودند. بنابراین در مرحله اول بررسی کیفیت دادههای خام توسط پیشفرضهای نرمافزار GEO2Rانجام شد. سپس ژنهای متفاوت بیان براساس شاخصهای P value>0.05و 2> LogFC >- 2شناسایی شدند. در ادامه بررسی روابط بین ژنها با استفاده از دیتابیس Stringو نرمافزار Cytoscapeانجام شد و برای شناسایی ژنهای هاب از معیار درجه استفاه شد. نشانگرهای مهم شناسایی شده شامل . میباشندSNU13 ,MRPS6 ,RPS14 ,GMPS, POLR3B , HSPA9 ,RPSAP58, SIL1 ,NDUFS3 , MRPS16