زهرا رودباری

برنامه رشد و نمو جنینی، پاسخ ارگانیسم پستانداران در زمان رشد بحرانی است که بر روی رشد و نمو از نظر کیفی تأثیر میگذارد. مطالعه ژنها راهی برای بهبود برنامه رشد و نمو جنینی و افزایش تولید گوشت ماهیچه اسکلتی است. در این تحقیق دادهها از پایگاه داده GEOبا شماره دسترسی GSE23563دانلود شدند. برای کنترل کیفیت دادههای خام و آنالیز تفاوت بیان ژنها از بسته LIMMAاستفاده شد. آنالیز ژن آنتولوژی و مسیرهای زیستی با استفاده از سرور آنلاین Enrichrصورت گرفت. از نرمافزار STRINGبرای یافتن تعاملات بین ژنها و از نرمافزار Cytoscapeبرای آنالیز بیشتر تعاملات و نمایش شبکه آنها استفاده شد. نتایج نشان داد که در بازه زمانی 70تا 120روز در دوران آبستنی در مجموع 445ژن و در بازه زمانی 120تا 135 روز در دوران آبستنی در مجموع 84ژن تفاوت بیان داشتند. با استفاده از نمودار مجموعه 34ژن مشترک بین این بازههای زمانی مشخص شد. نتایج ژن آنتولوژی و مسیر نشان داد که در بازه زمانی 70تا 120روز تنظیم تکثیر جمعیت سلولی، رشد و نمو بافت ماهیچهای سلولی، تمایز میوبلاست،تنظیم منفی رشد توسعه ای، تنظیم منفی فرآیند رشد و نمو، تنظیم مثبت رشد و نمو سلول، تنظیم تکثیر فیبروبلاست، مسیرهای سیگنالینگ ( )MAPK ،PPAR ،Rap1 ،HIF-1 ،PI3K-Aktتعامل گیرنده ،ECMمقاومت به انسولین و در بازه زمانی 120تا 135روز تنظیم تمایز سلولی، تنظیم تمایز سلولهای عضلانی، تنظیم مثبت تمایز سلولی، تنظیم مثبت فرآیند رشد و نمو، تنظیم تکثیر جمعیت سلولی، تنظیم منفی رشد، تنظیم منفی تکثیر جمعیت سلولی، رشد و نمو اندام جنینی، مسیرهای سیگنالینگ p53 ،MAPKفعالیتهای عملکردی و مسیرهای زیستی مهم مربوط به رشد و نمو ماهیچه اسکلتی در دوران آبستنی گوسفند بودند. ژنهای هاب TNFSF11 ،PTK7 ،ESR1و CEBPBدر بین ژنهای مشترک بین دو بازده زمانی مشخص شدند. از این ژنها میتوان در برنامه های اصلاح نژادی برای رفع مشکلات تولد دامها با وزن کم، کاهش تولید گوشت، بیماریهای ناشی از کم وزنی دام و افزایش مرگ و میر در زمان تولد استفاده کرد.