زهرا رودباری

پروتئینها به صورت واحدهای منفرد نمیتوانند عملکرد مناسبی را اجرا کنند بلکه آنچه باعث بروز یک فنوتیپ خاص میگردد، مجموعهای از برهمکنشهای پروتئینی است. تغییر بیان پروتئین معینی میتواند موجب بروز تغییرات مهمی در مسیرهای زیستی گردد. از بین پروتئینها تعدادی میتوانند در مسیرهای زیستی نقش مهمتری ایجاد کنند، این پروتئینها ارتباطات زیادی در سطح تعاملات ملکولی دارند و میتوانند موجب تغییر در عملکرد سلولی و تغییرات عمده در سطح فنوتیپی شوند. از جمله تغییرات فنوتیپی تولید شیر است که شیر و فراوردههای لبنی از مهمترین منابع غذایی مورد استفاده هستند. در تحقیق حاضر دادههای مورد استفاده با شماره دسترسی GSE33680از پایگاه دادهای Arrayexpressاستخراج گردید. قبل از آنالیز بیان ژنها با استفاده از بسته Limmaموجود در نرمافزار Rو با استفاده از روش مؤلفههای اساسی کنترل کیفیت دادهها انجام شد. سپس آنالیز جهت شناسایی ژنهای متفاوت بیان انجام شد و برای انتخاب ژنهای مؤثرتر در تولید شیر ژنها به نرمافزا DAVIDمعرفی شدند ، جهت ترسیم شبکه از نرمافزار Cytoscapeاستفاده شد . خوشههای پروتئینی توسط الگوریتم MCODEتعیین و بررسی گردید. 118ژن به نرمافزار Cytoscapeمعرفی شد و خروجی آن 6کمپلکس است که ژنهای ,APLN, BCA1, ADCY5, LPCAT1 CDH17 ARCبه ترتیب ژنهای seedهستند که نقش آنها در تولید شیر مورد بررسی قرار گرفت