01 آذر 1403
زهرا رودباري

زهرا رودباری

مرتبه علمی: دانشیار
نشانی: دانشگاه جیرفت
تحصیلات: دکترای تخصصی / علوم دامی
تلفن: 09132483343
دانشکده: دانشکده کشاورزی

مشخصات پژوهش

عنوان
ترسیم شبکه ژنی و شناسایی فرایندهای بیولوژیکی دخیل بر رشد گاوهای گوشتی سنین25-30 ماهگی
نوع پژوهش مقاله ارائه شده
کلیدواژه‌ها
بیوانفورماتیک، رشد، گاو گوشتی
پژوهشگران سعیده اسکندری نسب سیاهکوهی، زهرا رودباری، غلامرضا داشاب

چکیده

هنگامی که یک موجود زنده فرایند بیولوژیک انجام میدهد، زیر مجموعههای مختلفی از ژنها در مراحل مختلف بیان میشوند. بیان ژنها برای عملکرد صحیح سلول لازم است. تکنیکهای خوشهبندی برای درک عملکرد ژنها، ساماندهی ژنها، فرایندهای سلولی و زیرگونههای سلولها مفید است. در این مطالعه به منظور شناسایی فرایندهای بیولوژیکی دخیل در رشد گاو گوشتی و ترسیم شبکه ژنی، دادههای ریزآرایه مربوط به بافت ماهیچهای گوساله گوشتی سنین 25-30ماهگی از پایگاه دادهای GEOبا شماره دسترسی GSE-25554دانلود شدند. پس از شناسایی ژن های تغییر بیان یافته از نرمافزار Cytoscapeبرای ساخت شبکه تنظیم بیان ژن و مطالعه روابط بین ژنهای دخیل در رشد و نمو ماهیچه گاو گوشتی استفاده شد. شناسایی فرایندهای بیولوژیکی مرتبط با ژنهای هاب با استفاده از پایگاه دادهای )WebGestalt (WEB- based Gene set analysis toolkit صورت گرفت. ژنهای FN1, C3, FCG, PC, PCK1هابترین ژنهای شبکه هستند و نقش عملکردی آنها بر تولید گوشت در مطالعات دیگر به اثبات رسیده است. فرایندهای متابولیکی از مهمترین فرایندهای بیولوژیکی شناخته شده در این مطالعه neutral lipid ،triglyceride biosynthetic process ژن در این فرایند فعالیت دارند. مسیرهای66 ژن از54 است که درDGAT1, DGAT2, PCK1, PCK2,C3 از مسیرهای مؤثر در فرایند رشد هستند که ژنهایbiosynthetic process این مسیرها نقش دارند