15 اردیبهشت 1403

اسرا سالاری

مرتبه علمی: استادیار
نشانی:
تحصیلات: دکترای تخصصی / بیماری شناسی گیاهی-دانشکده کشاورزی
تلفن:
دانشکده: دانشکده کشاورزی

مشخصات پژوهش

عنوان
مقایسه دو روش استخراج RNA در شناسایی ویروس پژمردگی لکه ای گوجه فرنگی
نوع پژوهش مقاله ارائه شده
کلیدواژه‌ها
استخراج RNA، ویروس پژمردگی لکه ای گوجه فرنگی، PCR
پژوهشگران سیده عاطفه حسینی، اسرا سالاری

چکیده

ویروس پژمردگی لکه ای گوجه فرنگی در جنس توسپوویروس و خانواده بونیاویریده، جزو ده ویروس با اهمیت و خسارتزای دنیا است. ویروس مذکور دارای ژنوم RNA تک رشته منفی است که جهت شناسایی آن از روش های مولکولی و آزمون RT-PCR با آغازگر اختصاصی استفاده می گردد. بدین منظور در مرحله اول نیاز به استخراج RNA می باشد. با توجه به اهمیت استخراج RNA با غلظت بالا و خالص در بررسی های مولکولی، تحقیق حاضر به مقایسه دو روش تریازول و CTAB تغییر یافته در 20 نمونه گوجه فرنگی مشکوک به آلودگی با ویروس پژمردگی لکه ای گوجه فرنگی پرداخته است. بدین منظور دو روش مذکور، بر اساس دستورالعمل های موجود در منابع انجام شد و غلظت RNA کل حاصل با دستگاه نانودراپ سنجیده شد. نتایج موید این مطلب بود که غلظت RNA با روش تریازول حداقل 001/0 و حداکثر 023/0 نانوگرم در میلی لیتر و در روش CTAB تغییر یافته حداقل 234/0 و حداکثر 897/0 نانوگرم در میلی لیتر بر آورد شد. بنا براین روش CTAB تغییر یافته، قابلیت استخراج RNA با غلظت بسیار بالاتری نسبت به روش تریازول از بافت برگی گوجه فرنگی دارد.