09 تیر 1405

اسرا سالاری

مرتبه علمی: استادیار
نشانی:
تحصیلات: دکترای تخصصی / بیماری شناسی گیاهی-دانشکده کشاورزی
تلفن:
دانشکده: دانشکده کشاورزی

مشخصات پژوهش

عنوان
شناسایی مولکولی ویروس اس سیب زمینی در ایران
نوع پژوهش مقاله چاپ شده
کلیدواژه‌ها
تبارزایی، پوشش پروتئینی، نسخه برداری معکوس
پژوهشگران فرامرز جانبرارزاده، سیده عاطفه حسینی، اسرا سالاری

چکیده

ویروس ­اس ­سیب­زمینی از عوامل خسارت­زا و محدود کننده کشت این گیاه در استان مازندران در شمال ایران است. این ویروس متعلق به جنس کارلاویروس با پیکره چند وجهی و ژنوم RNA تک رشته ای و دامنه میزبانی نسبتا محدود است. این ویروس معمولا دارای اثر افزایشی و همراه با سایر ویروس­ های سیب زمینی در گیاه حضور دارد. نظر به مشاهده نشانه ­های شیوع و خسارت این ویروس در مزرعه­ های سیب­ زمینی استان مازندران این پژوهش برای شناسایی مولکولی و تعیین مناطق انتشار ویروس، در این استان اجرا گردید. تعداد 94 نمونه گیاهی از مزرعه های سیب­زمینی سه منطقه سوادکوه، گلوگاه و پرکوه در استان مازندران، طی سالهای 1402-1403 جمع آوری گردیدند. RNA کل ویروس از نمونه ­های دارای نشانه­ های شدید بیماری استخراج گردید و به روش RT-PCR ، ناحیه ژنی پوشش پروتئینی ویروس تکثیر گردید و باندی به اندازه 1118 جفت باز تشخیص داده شد. یک نمونه مثبت از هر منطقه انتخاب و برای تعیین توالی به شرکت ماکرو ژن کره ارسال گردیدند. پس از تعیین توالی ها میزان تشابه آن ها با توالی این ناحیه ژنی سایر جدایه­های این ویروس با استفاده از نرم­ افزارهای تبارشناسی تعیین گردید. نتایج نشان داد که جدایه ­های ایرانی این ویروس در دو گروه قرار دارند، گروه یک شامل جدایه ­های ایران، سوریه، کره­ جنوبی، چین، آلمان و در گروه دو تنها دو جدایه ایرانی قرار گرفتند. شناسایی مولکولی جدایه ­های این ویروس در این استان، مناطق انتشار آن ها و شباهت ژنتیکی آنها با جدایه ­های سایر کشورها برای نخستین بار گزارش می­ شود.