زهرا رودباری

چربی داخل عضلانی) (IMFکه به صورت ظاهری مرمری در گوشت مشاهده میشود، بهطور قابل توجهی بر طعم، لطافت و آبدار بودن گوشت گاو اثر گذاشته، کیفیت کلی آن را افزایش داده، ترجیحات مصرفکننده را برآورده ساخته و بازده اقتصادی را بهبود میبخشد. رسوب IMFتحت کنترل شبکههای پیچیده ژنتیکی و اپیژنتیکی شامل ژنهای کدکننده و RNAهای غیرکدکننده (مانند miRNAها) قرار دارد. این مطالعه با هدف شناسایی مکانیسمهای مولکولی دخیل در رسوب IMFو کشف نشانگرهای ژنتیکی مرتبط با بهبود کیفیت گوشت، تحلیل جامعی از ترنسکریپتوم انجام شد. دادههای RNA-Seqاز 21نمونه ( 4تکرار زیستی) از نژادهای هرفورد (Her؛ با محتوای چربی بالا)، هلشتاین-فریزن (Hf؛ با محتوای چربی متوسط) و لیموزین (Lim؛ با محتوای چربی پایین) با پلتفرم Illumina NovaSeqX Plusتولید شد. دادهها با استفاده از نرم افزار HISAT1همتراز و با DESeq1برای شناسایی ژنهای بیان تفاضلی ( )DEGsتحلیل شدند ) p-value < .0.0و | )log1FC| > .00در مقایسه هرفورد/لیموزین 3/.10ژن و در مقایسه هلشتاین/لیموزین 4/4.4ژن بهطور معنیداری بیان متفاوت داشتند. تجزیهوتحلیل شبکه برهمکنش پروتئین-پروتئین ( )PPIژنهای هاب کلیدی )TargetScan وmiRWalk ها (باmiRNA را شناسایی کرد. پیشبینیRXRA وSQLE ،PLIN1 ،SCD ،SMAD3 مانند چندین miRNAکلیدی شامل miR-1422-3p ،miR-1.0 ،miR-231و miR-32را که این ژنها را هدف قرار میدهند، مشخص نمود. همچنین شناسایی موتیفهای تنظیمی و جایگاههای اتصال فاکتورهای رونویسی نشان داد که مسیرهای متابولیسم اسیدهای چرب، سیگنالینگ Wnt ،PI3K-Akt ،PPARو cAMPنقش مهمی در رسوب IMFدارند. این یافتهها چارچوب جامعی از مکانیسمهای مولکولی مؤثر در کیفیت گوشت گاو فراهم کرده و اهداف بالقوهای برای برنامههای اصلاح نژاد و استراتژیهای تغذیهای به منظور بهبود ویژگی مرمری گوشت ارائه میدهد