14 آذر 1404
زهرا رودباري

زهرا رودباری

مرتبه علمی: دانشیار
نشانی: دانشگاه جیرفت
تحصیلات: دکترای تخصصی / علوم دامی
تلفن: 09132483343
دانشکده: دانشکده کشاورزی

مشخصات پژوهش

عنوان
تجزیه و تحلیل پروفایل ژنومی مرتبط با مقاومت به کنه ریپیسفالوس میکروپلاس در گاوهای هلشتاین: "یک مطالعه ترانسکریپتومیک"
نوع پژوهش مقاله ارائه شده
کلیدواژه‌ها
مقاومت به کنه، ترانسکریپتوم پوست، ریزآرایه، ژن های هاب، پاسخ ایمنی میزبان
پژوهشگران حمیده نوری صادق، زهرا رودباری

چکیده

این مطالعه با هدف بررسی مکانیسمهای مولکولی مقاومت به کنه ریپیسفالوس میکروپلاس در گاوهای هلشتاین انجام شد. پوست به عنوان محل اصلی تغذیه کنه، نقش محوری در پاسخ ایمنی میزبان ایفا میکند. با استفاده از فناوری ریزآرایه، پروفایلهای رونویسی پوست گاوهای آلوده و غیرآلوده مورد مقایسه قرار گرفت. دادههای بیان ژن با شماره دسترسی GSE15342از پایگاه GEOاستخراج و با ابزار GEO2Rتجزیه و تحلیل شدند. نتایج نشان داد 1197ژن با بیان متفاوت ( )DEGsوجود دارد که 405 ژن افزایش و 792ژن کاهش بیان معنادار داشتند. از این میان پنج ژن کلیدی ( FGF2 ،CCL2 ،ICAM1 ، MMP9و ITGB2 ) با استفاده از الگوریتم DEGREEدر نرمافزار Cytoscapeشناسایی شدند. تحلیل غنیسازی عملکردی با پایگاههای DAVID و ،Gene Ontologyمشارکت این ژنها را در پاسخهای ایمنی و التهابی تأیید کرد. تحلیلهای بیوانفورماتیکی نشان داد که ژن MMP9در تنظیم پاسخ ایمنی، ICAM1در نفوذپذیری عروقی، CCL2در جذب سلولهای ایمنی، FGF2در ترمیم بافت و ITGB2در چسبندگی لکوسیتها نقش دارند. همچنین، مسیرهای سیگنالینگ مهمی مانند PI3K-Aktو فاگوزوم در پاسخ به آلودگی کنه فعال میشوند. این یافتهها از دو جنبه حائز اهمیت هستند: نخست آنکه درک ما را از مکانیسمهای مولکولی مقاومت به کنه افزایش میدهند و دوم آنکه میتوانند به عنوان نشانگرهای ژنتیکی در برنامههای اصلاح نژادی برای تولید گاوهای مقاوم مورد استفاده قرار گیرند. استفاده از این رویکرد ژنومیکی میتواند راهکاری پایدار و سازگار با محیط زیست برای کنترل آلودگیهای کنهای ارائه دهد و وابستگی به کنهکشهای شیمیایی را کاهش دهد. نتایج این مطالعه پایهای برای تحقیقات آینده در زمینه توسعه واکسنها و روشهای ایمونولوژیک کنترل کنه فراهم میکند.