14 آذر 1404
زهرا رودباري

زهرا رودباری

مرتبه علمی: دانشیار
نشانی: دانشگاه جیرفت
تحصیلات: دکترای تخصصی / علوم دامی
تلفن: 09132483343
دانشکده: دانشکده کشاورزی

مشخصات پژوهش

عنوان
شناسایی miRNAهای کنترل کننده عفونت ویروسی آنفولانزا در طیور
نوع پژوهش مقاله ارائه شده
کلیدواژه‌ها
پروفایل بیانی، ژن های مقاوم به بیماری ، ویروس آنفولانزا
پژوهشگران آزاده ترابی، زهرا رودباری

چکیده

هدف: ویروس H9N2آنفولانزا به طور گسترده در پرندگان جهانی شیوع دارد و با کاهش رشد و تولید تخم مرغ، خسارات اقتصادی سنگینی به صنعت مرغداری وارد میکند. این ویروس علاوه بر ایجاد عفونتهای شدید و تلفات، با کاهش اثر واکسنها و القای عفونتهای ثانویه، کنترل بیماری را دشوار میسازد. مطالعه تغییرات ژنی وشناسایی miRNAها میتواند راهکارهای نوینی برای مقابله ارائه دهد. مواد و روشها: در این تحقیق، بهمنظور درک بهتر پاسخ میزبان به عفونت ویروسی، پروفایل بیان ژنها در سلولهای ریه مرغ آلوده به ویروس آنفولانزای ) (H5N1طی 24 ساعت مورد بررسی قرار گرفت. دادههای ریزآرایه از پایگاه ArrayExpressاستخراج و با استفاده از پکیجهای تخصصی در نرمافزار Rپردازش شدند. پس از نرمالسازی دادهها، ژنهای با تغییرات بیان معنادار )| |FoldChange>2و -P (value<0.05شناسایی شدند. در ادامه، شبکههای تعاملی ژنها با نرمافزار Cytoscapeترسیم و ژنهای کلیدی )هاب( بر اساس درجه اتصال تعیین گردیدند. همچنین، miRNAهای تنظیمکننده این ژنها با ابزارهای بیوانفورماتیکی پیشبینی شدند. نتایج : تجزیه و تحلیل داده ها منجر به شناسایی 7779ژن تحت تاثیر عفونت شد که از این میان، 883ژن با تغییرات بیان چشمگیر ) 512ژن القاشده و 371ژن مهارشده( بود. آنالیز شبکه سه گره محوری )ژنهای هاب( در شبکه را مشخص نمود: -1ژن ) UBBژن کنترل کننده مسیر پروتئولیز(، -2ژن PXDN )تعدیل ماتریکس خارج سلولی( و -3ژن ) PIK3CAترانسداکشن پیام سلولی(. شبیهسازیهای بیوانفورماتیکی برهمکنش این ژنها را با miRNA 34دارای نقش تنظیم ایمنی از جمله miR-155و ) miR-146وابسته به التهاب( و نیز ) miR-21ضدویروس( و اعضای خانواده let-7پیشبینی کرد که حاکی از مشارکت آنها در تنظیم پاسخهای دفاعی میزبان است. نتیجه گیری: یافتههای این مطالعه نشان میدهد که تحلیل جامع پروفایل های بیانی میتواند به درک بهتر پاتوژنز ویروس آنفولانزای پرندگان کمک کند. علاوه بر این، شناسایی miRNAهای کلیدی و ژنهای هدف آنها میتواند راه را برای توسعه استراتژیهای درمانی نوین، از جمله طراحی واکسنهای مؤثرتر یا روشهای درمانی مبتنی بر ،RNAهموار سازد. این نتایج گامی مهم در جهت کنترل بیماریهای ویروسی در صنعت طیور محسوب میشود