مرتضی مختاری

هدف از مطالعه حاضر شناسایی نشانگرهای مولکولی EST-SSR در بز بود. تعداد 14213 توالی EST بز از سایت NCBI برای آنالیز SSR دانلود گردید. با استفاده از نرم افزار SSRLocator آنالیزEST ها انجام گردید که تعداد 414 توالی EST دارای 434 SSR بودند. در بین این EST-SSR ها موتیف های دی نوکلئوتید داری بیشتر فراوانی (94/41%) و پس از آن به ترتیب موتیف های تری نوکلئوتید(27/23 %)، هگزانوکلئوتید (89/21 %)، پنتا نوکلئوتید (76/8 %)و تترانوکلئوتید (15/4 %) قرار گرفتند. در بین توالی های تکراری دی، تری، تترا، پنتا و هگزا نوکلئوتید به ترتیب تیپ های AC/TG (25/41 %)، GCC/CGG (81/18 %)، CAAA (67/16 %)، AAAAC (32/26 %) و CATCAC (58/11 %) دارای بیشترین فراوانی بودند. همچنین انوتیشن نشانگرهای EST-SSR انجام گردید. حدود چهارصد جفت پرایمر بصورت تصادفی با استفاده از نرم افزار پرایمر3 جهت انجام آزمایشات تایید طراحی گردید. نشانگرهای EST-SSR شناسایی شده یک منبع با ارزش برای مطالعات بیشتر در زمینه مولکولی،اصلاحی، ژنتیکی و ژنومیکی برای گونه بز و سایر گونه های مرتبط خواهند بود.