11 بهمن 1404

اسرا سالاری

مرتبه علمی: استادیار
نشانی:
تحصیلات: دکترای تخصصی / بیماری شناسی گیاهی-دانشکده کشاورزی
تلفن:
دانشکده: دانشکده کشاورزی

مشخصات پژوهش

عنوان
بررسی ساختار ژنتیکی و واکاوی تبارزایی جدایه های ایرانی و عمّانی ویروس پیچیدگی برگ فلفل
نوع پژوهش مقاله ارائه شده
کلیدواژه‌ها
بگوموویروس، تنوع ژنتیکی، تبارزایی، چندشکلی نوکلئوتیدی.
پژوهشگران اسرا سالاری، سیده عاطفه حسینی، اکرم توکلی بردسکن

چکیده

ویروس پیچیدگی برگ فلفل (chilli leaf curl virus, ChiLCV) با نام دوبخشی Begomovirus chillicapsici متعلق به جنس Begomovirus از خانواده Geminiviridae می باشد. ژنوم دی اِن اِی حلقوی تک لا، حدود 7/2 کیلوباز طول دارد که در پیکره های دوقلوی بهم چسبیده پوشش دار شده است. ویروس توسط سفیدبالک Bemisia tabaci به روش پایا-گردشی منتقل می شود. به منظور بررسی ساختار ژنتیکی و واکاوی تبارزایی جدایه های ایرانی و عمّانی ویروس پیچیدگی برگ فلفل، توالی نوکلئوتیدی 24 جدایه ایرانی و عمّانی از ژن بانک استخراج و تحت واکاوی ژنتیکی قرار گرفت. در درخت تبارزایی جدایه های ایرانی در کنار جدایه های عمّانی قرار گرفتند. مقدار یکسانی ترادف نوکلئوتیدی جدایه های ایرانی و عمّانی بین 80/99-10/94 درصد محاسبه شد. واکاوی چندشکلی نوکلئوتیدی منجر به شناسایی 14 هاپلوتیپ در بین توالی ها شد. تعداد 235 جایگاه چندشکلی با تنوع هاپلوتیپی و نوکلئوتیدی به ترتیب برابر با 02761/0 و 862/0 محاسبه گردید. میانگین تعداد تفاوت های نوکلئوتیدی 029/76 بود. نرخ های جایگزینی غیرمترادف (dN) و مترادف (dS) نیز به ترتیب 6542/2 و 8342/1 محاسبه شد. نسبت dN/dS برابر با 44706/1 بود. نتایج بدست آمده نشان دهنده وجود فشار انتخاب مثبت بر روی ژنوم ویروس و همچنین تنوع نسبی درون جمعیت های مورد بررسی بود که میتواند تهدیدی برای افزایش دامنه میزبانی ویروس یا غلبه بر ارقام مقاوم باشد.