فاطمه نظری

در مطالعات تنوع زیستی به طور معمول از ژن 18S استفاده می شود که به خوبی می تواند تغییرات بین گونه ای را نشان دهد. با استفاده از روش کوانتومی MM-UFF پایداری دمایی اولیگونوکلئوتیدی به طول 60 نوکلئوتید از ناحیه یکسانی از ژن ریبوزومی 18S گونه های جنس Tigriopus را محاسبه شد. ما از شبیه سازی دینامیک مولکولی کاملاً اتمی برای مطالعه ساختار و پایداری انرژی این توالی های ژنی استفاده کردیم. از آنجایی که ساختار حقیقی را نمی توان به صورت تجربی تعیین کرد بنابراین از شبیه-سازی کامپیوتری برای مدل سازی ساختار و تعیین پایداری استفاده شد. براساس نتایج به دست آمده مقدار محاسبه شده برای توالی انتخاب شده تقریباً در همه گونه ها یکسان بود.